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细胞器基因组相关数据较为分散,这阻碍了对药用植物的细胞器基因组的系统研究。因此,我们建立了1000种药用植物基因组综合数据库(1KMPG)。这里包含了,药用植物的细胞器基因组--核基因组,叶绿体基因组和线粒体基因组。目前,1KMPG数据库包括xxx个核基因组、xxx个叶绿体基因组和xxx个线粒体基因组的数据,这些基因组涉及到xxx个植物物种。

此外,1KMPG数据库中嵌入了主要的基因组分析工具。包括用于从不同植物中寻找同源序列的BLAST;用于在数据库中实现物种鉴定的Species Identification;用于鉴定蛋白质结构域的HmmSearch;由于鉴定三种重复序列的Repeats Finder;用于浏览基因组的JBrowse;用于显示两个基因组之间的同源块的Synteny Viewer。
还包括由我们团队开发的两个叶绿体基因组工具网站,CPGAVAS2网站(https://doi.org/10.1093/nar/gkz345):叶绿体基因组组注释网站;和CPGview网站:叶绿体基因组可视化网站。这些工具将有助于对药用植物的细胞器基因组进行系统分析。

您可以通过网页的更新信息版块,及时查看1KMPG数据库报告的新数据。